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荧光化合物的使用使得细胞显影为细胞功能的分析提供了广泛的信息。细胞的各种活动和结构可成为荧光化合物的染色目标。最常染色的细胞组份为细胞膜、蛋白质和核苷。

  染料名 检测法 荧光色 λex (nm) λem (nm) 染色参考
  BCECF-AM 荧光 绿 490 526 进入细胞内AM体分解
  Calcein-AM 荧光 绿 490 515 进入细胞内AM体分解
  CFSE 荧光 绿 496 516 结合细胞内的蛋白质
荧光时间持续较长
  FDA 荧光 绿 488 530 細胞内加水分解
  MitoRed 荧光 560 580  
  Rh123 荧光 绿 507 529  
  DAPI 荧光 360 460 结合死细胞的核酸
  EB 荧光 520-525 615 结合死细胞的核酸
  Hoechst 33258 荧光 350 461 结合活细胞/死细胞核酸
  Hoechst 33342 荧光 352 461 结合死细胞的核酸
  PI 荧光 530 620 只能染色死細胞(蓝色)
  Trypan Blue 染色  
  FSB 紫外光 绿 390 511  

◎ 细胞质
◎ 线粒体
◎ 细胞核
◎ 细胞膜
◎ β-淀粉样物质
◎ 细胞活死双染